ການຄົ້ນຫາ RNA Interfering ຂະຫນາດນ້ອຍແລະການນໍາໃຊ້ໃນການຄົ້ນຄວ້າພັນທຸກໍາໂມເລກຸນ
siRNA, ເຊິ່ງຢືນສໍາລັບອາຊິດ Ribonucleic ຂະຫນາດນ້ອຍ, ເປັນຊັ້ນຂອງໂມເລກຸນ RNA ສອງ stranded. ບາງຄັ້ງມັນຖືກເອີ້ນວ່າ RNA ແຊກແຊງສັ້ນຫຼື RNA silencing.
ກ່ອນທີ່ຈະເຂົ້າໄປໃນສິ່ງທີ່ແທ້ຈິງ siRNA ແມ່ນ, ມັນເປັນສິ່ງສໍາຄັນທີ່ຈະຮູ້ກ່ຽວກັບຫນ້າທີ່ຂອງ RNAs. Ribonucleic Acid (RNA) ແມ່ນອາຊິດນິວເຄຼິກທີ່ມີຢູ່ໃນຈຸລັງທີ່ມີຊີວິດຊີວາແລະເຮັດຫນ້າທີ່ເປັນຜູ້ນໍາໃຊ້ຄໍາແນະນໍາຈາກ DNA ເພື່ອຄວບຄຸມການສັງລວມຂອງໂປຣຕີນ (ຫມາຍເຫດ: ໃນ RNA ບາງຊະນິດແທນທີ່ຈະ DNA ນໍາຂໍ້ມູນກ່ຽວກັບທາງພັນທຸກໍາ).
RNA ການແຊກແຊງຂະຫນາດນ້ອຍ (siRNA) ແມ່ນຂີ້ຂະຫນາດນ້ອຍຂອງ RNA ສອງ stranded (Ds) RNA, ປົກກະຕິແລ້ວກ່ຽວກັບ 21 nucleotides ຍາວ, ມີ 3 'overhangs (2 nucleotides) ຢູ່ປາຍແຕ່ລະທີ່ສາມາດຖືກນໍາໃຊ້ເພື່ອ "ແຊກແຊງ" ກັບການແປຂອງທາດໂປຼຕີນໂດຍຜູກພັນ ເພື່ອສົ່ງເສີມການຫຼຸດລົງຂອງ RNA messenger (mRNA) ຢູ່ໃນລໍາດັບສະເພາະ.
ໃນການເຮັດດັ່ງນັ້ນ siRNA ປ້ອງກັນການຜະລິດໂປຼຕີນໂດຍສະເພາະຕາມລໍາດັບ nucleotide ຂອງ mRNA ທີ່ສອດຄ້ອງກັນຂອງພວກເຂົາ. ຂະບວນການນີ້ເອີ້ນວ່າ RNA interference (RNAi), ແລະອາດຈະຖືກເອີ້ນວ່າ siRNA silencing ຫຼື siRNA knockdown.
ບ່ອນທີ່ພວກເຂົາມາຈາກ
siRNA ຖືກຖືວ່າໄດ້ມາຈາກສາຍແຂນຍາວຂອງການເຕີບໂຕທາງດ້ານກໍາລັງກາຍຫຼືອອກກໍາລັງກາຍຈາກພາຍນອກຂອງອົງການ) RNA ເຊິ່ງໄດ້ຖືກເອົາຂຶ້ນໂດຍຫ້ອງແລະໄດ້ຮັບການປຸງແຕ່ງຕື່ມອີກ.
RNA ມັກຈະມາຈາກ vectors ເຊັ່ນ viruses ຫຼື transposons ແລະໄດ້ຖືກພົບເຫັນວ່າມີບົດບາດໃນການປ້ອງກັນ antiviral, ການເຊື່ອມໂຊມຂອງ mRNA ທີ່ຜະລິດຕະພັນທີ່ຜະລິດຫຼາຍເກີນໄປຫຼື mRNA ສໍາລັບການແປພາສາໄດ້ຖືກຍົກເລີກ, ແລະການປ້ອງກັນການຂັດຂວາງຂອງ DNA genomic ໂດຍ transposons.
ແຕ່ລະ strand siRNA ມີກຸ່ມ phosphate 5 'ແລະກຸ່ມ 3' hydroxyl (OH). ພວກມັນແມ່ນຜະລິດອອກຈາກ dsRNA ຫຼື RNA ທີ່ລອກລາກໆ, ເຊິ່ງຫຼັງຈາກເຂົ້າໄປໃນຫ້ອງນັ້ນກໍ່ຖືກແບ່ງອອກໂດຍ enzyme RNase III, ເອີ້ນວ່າ Dicer , ໃຊ້ RNase ຫຼື enzyme ຈໍາກັດ . ຫຼັງຈາກນັ້ນ, siRNA ໄດ້ຖືກລວມເຂົ້າໄປໃນສະລັບສັບຊ້ອນທາດໂປຼຕີນຫຼາຍທີ່ເອີ້ນວ່າສະລັບສັບຊ້ອນ silencing RNAi (RISC).
RISC "ຊອກຫາ" mRNA ເປົ້າຫມາຍທີ່ເຫມາະສົມ, ບ່ອນທີ່ siRNA ຫຼັງຈາກນັ້ນ unwinds ແລະ, ເຊື່ອວ່າ, strand antisense directs ການເຊື່ອມໂຊມຂອງ strand ຂອງ mRNA, ການນໍາໃຊ້ປະສົມປະສານຂອງ enzyme endo- ແລະ exonuclease.
ການໃຊ້ຢາແລະການປິ່ນປົວດ້ວຍຢາ
ໃນເວລາທີ່ມີຈຸລັງ mammal ແມ່ນປະເຊີນຫນ້າກັບ RNA ສອງ stranded ເຊັ່ນ siRNA, ມັນອາດຈະຜິດພາດມັນເປັນຜະລິດຕະພັນຂອງໄວຣັສແລະເລີ່ມຕົ້ນການຕອບສະຫນອງພູມຕ້ານທານ. ນອກຈາກນັ້ນ, ການນໍາໃຊ້ siRNA ອາດຈະເຮັດໃຫ້ເກີດການກໍາຈັດເປົ້າຫມາຍທີ່ບໍ່ໄດ້ຄາດຫວັງ, ບ່ອນທີ່ທາດໂປຼຕີນອື່ນທີ່ບໍ່ແມ່ນໄພຂົ່ມຂູ່ອື່ນໆອາດຖືກໂຈມຕີແລະຖືກທໍາລາຍ.
ການແນະນໍາ siRNA ຫຼາຍເກີນໄປກັບຮ່າງກາຍສາມາດເຮັດໃຫ້ເກີດເຫດການທີ່ບໍ່ສໍາຄັນເນື່ອງຈາກການກະຕຸ້ນຂອງການຕອບສະຫນອງຂອງພູມຄຸ້ມກັນຈາກທໍາມະຊາດ, ແຕ່ໃຫ້ຄວາມສາມາດທີ່ຈະຊະນະຊະນິດໃດໆທີ່ມີຄວາມສົນໃຈ, siRNAs ມີທ່າແຮງສໍາລັບການນໍາໃຊ້ການປິ່ນປົວຈໍານວນຫຼາຍ.
ໂດຍການດັດແປງທາງເຄມີຂອງ siRNAs ເພື່ອເສີມຂະຫຍາຍຄຸນສົມບັດການປິ່ນປົວຂອງເຂົາເຈົ້າເຊັ່ນ:
- ກິດຈະກໍາທີ່ເພີ່ມຂຶ້ນ
- ສະຖຽນລະພາບຂອງ serum ເພີ່ມຂຶ້ນແລະເປົ້າຫມາຍຫນ້ອຍລົງ
- ຫຼຸດລົງການເຄື່ອນໄຫວ immunological
ພະຍາດຫຼາຍຢ່າງສາມາດໄດ້ຮັບການປິ່ນປົວໂດຍ inhibiting ການສະແດງອອກຂອງເຊື້ອໂຣກ. ດັ່ງນັ້ນ, ການອອກແບບຂອງ siRNA ສັງເຄາະສໍາລັບການນໍາໃຊ້ການປິ່ນປົວໄດ້ກາຍເປັນຈຸດປະສົງທີ່ເປັນທີ່ນິຍົມຂອງບໍລິສັດປິໂຕລຽມຈໍານວນຫຼາຍ.
ຖານຂໍ້ມູນລາຍລະອຽດກ່ຽວກັບການປ່ຽນແປງທາງເຄມີທັງຫມົດແມ່ນຖືກນໍາໃຊ້ດ້ວຍຕົນເອງຢູ່ siRNAmod, ຖານຂໍ້ມູນທີ່ໄດ້ຮັບການຮັກສາໄວ້ຢ່າງເປັນທາງການຂອງ siRNA ດັດແປງທາງເຄມີ.
ແຫຼ່ງຂໍ້ມູນ:
Tsai, CS Biomacromolecules: Introduction to structure, function and informatics. Wiley-Liss, 2007.
Whitehead, KA Dahlman, JE Langer, RS Anderson, DG (2011). "Silencing or Stimulation? SiRNA Delivery ແລະລະບົບພູມຕ້ານທານ". ການທົບທວນປະຈໍາປີຂອງວິສະວະກໍາເຄມີແລະຊີວະມວນ 2 : 77-96.
Alekseev OM, Richardson RT, Alekseev O, O'Rand MG (2009). "ການວິເຄາະຮູບແບບການສະແດງອອກຂອງເຊື້ອໃນຈຸລັງ HeLa ໃນການຕອບສະຫນອງຕໍ່ການ oververexpression ຫຼືການສູນເສຍ mediated ຂອງ NASP". ຊີວະວິທະຢາການສືບພັນແລະ Endocrinology: 45.