ຜູ້ນໍາໃນເຕັກໂນໂລຍີ Single Molecule
ເຖິງວ່າຈະມີຂໍ້ຈໍາກັດໃນຄວາມໄວ, ຄວາມໄວແລະຂະຫນາດຂອງລໍາດັບທີ່ສາມາດຮັບໄດ້, ວິທີການ sequencing ໃຫມ່ທີ່ໄດ້ອະທິບາຍໄວ້ໃນ PNAS ແມ່ນ novel ແລະສະແດງໃຫ້ເຫັນຄໍາສັນຍາທີ່ພຽງພໍທີ່ຈະຈັບຕາຂອງນັກລົງທຶນທີ່ກ່ຽວຂ້ອງກັບວິຊາການກ່ຽວກັບການລົງທຶນໃນເຕັກໂນໂລຢີລາວ. ມີຄວາມຕ້ອງການບາງສິ່ງບາງຢ່າງກ່ຽວກັບເຕັກນິກທີ່ນັກລົງທຶນທຸລະກິດກໍາລັງຊອກຫາຍ້ອນວ່າ ນີ້ແມ່ນຄັ້ງທໍາອິດ , ອີງຕາມສະມາຊິກພະນັກງານທີ່ໃຊ້ເວລາດົນນານແລະຜູ້ອໍານວຍການອາວຸໂສດ້ານການຄົ້ນຄວ້າ, ທ່ານດຣ Timothy ແຮຣິດ ... ນັກວິທະຍາສາດ, ມັນເປັນວິທີທາງອື່ນ ໆ !
ຫນັງສືພິມ PNAS ຖືກປ່ອຍອອກມາເມື່ອວັນທີ 1 ເມສາ 2003, ຮອບທໍາອິດຂອງການລົງທຶນສໍາລັບບໍລິສັດໃຫມ່ໄດ້ເລີ່ມຕົ້ນໃນວັນທີ 19 ເດືອນທັນວາປີ 2003, ແລະໃນວັນທີ 2 ເດືອນມັງກອນປີ 2004, Helicos ເປີດປະຕູຂອງຕົນດ້ວຍ 5 ພະນັກງານ, ລວມທັງທ່ານດຣ Harris, ຜູ້ຊ່ຽວຊານດ້ານວິທະຍາສາດການວັດແທກແລະເຕັກໂນໂລຊີໂມເລກຸນດຽວ. Helicos ແມ່ນຕັ້ງຢູ່ໃນ Cambridge MA, USA ແລະຫຼັງຈາກ 2 ຮອບຂອງການລົງທຶນລົງທຶນ, ແລະເປັນ IPO ໃນວັນທີ 27 ເດືອນພຶດສະພາປີ 2007, ມັນໄດ້ຖືກຊື້ຂາຍໃນປະຈຸບັນຢູ່ພາຍໃຕ້ Nasdaq: HLCS .
Helicos ແມ່ນເຕັກໂນໂລຢີທາງດ້ານພັນທຸກໍາ, ໂດຍສະເພາະແມ່ນເຕັກໂນໂລຢີ ແບບດຽວກັບໂມເລກຸນ True ( ເຕັກໂນໂລຢີ TSMS TM ) , ຖືກຢືນຢັນກັບລໍາດັບຂອງ genome virus M13 ດັ່ງທີ່ໄດ້ອະທິບາຍໄວ້ໃນວາລະສານວິທະຍາສາດໃນເດືອນເມສາ 2008. ໂຕເອັກສ໌ເຕີ tSMS TM ໃຊ້ HeliScope TM ດຽວ Molecule Sequencer
ອີງຕາມທ່ານດຣ Harris, ໂຄງການດັ່ງກ່າວນີ້ໄດ້ເລີ່ມຕົ້ນໃນເດືອນມັງກອນປີ 2004 ແລະໃນເດືອນມິຖຸນາ 2005 ພວກເຂົາໄດ້ຕິດຕັ້ງເຊື້ອໄວຣັສ M13, ລໍາດັບທີ່ກ່ຽວຂ້ອງທາງດ້ານການແພດທີ່ໄດ້ອະທິບາຍໄວ້ໃນເອກະສານວິທະຍາສາດ.
tSMS TM ເຮັດແນວໃດ?
ສາຍພັນຂອງ DNA ກ່ຽວກັບ 100-200 ຄູ່ຄູ່ແມ່ນຖືກຕັດເຂົ້າໄປໃນຊິ້ນສ່ວນຂະຫນາດນ້ອຍໂດຍນໍາໃຊ້ enzym ຈໍາກັດ ແລະ polyA ຫາງແມ່ນເພີ່ມ. ຫຼັງຈາກນັ້ນ, ສາຍແຂນສັ້ນໄດ້ຖືກປະສົມປະສານກັບແຜ່ນຫີນເຊນ Helicos, ເຊິ່ງມີຫລາຍພັນຕື້ ໂພລິເມີທີ່ ຜູກມັດກັບຫນ້າດິນຂອງມັນ. ຕົວແບບປະສົມປະສານແຕ່ລະຄົນແມ່ນລໍາດັບພ້ອມໆກັນ. ດັ່ງນັ້ນຈິ່ງສາມາດອ່ານລາຍງານຕໍ່ຕື້ໂດລາ. ການປ້າຍກໍາກັບແມ່ນປະຕິບັດຢູ່ໃນ "quads" ເຊິ່ງປະກອບດ້ວຍ 4 ຮອບແຕ່ລະຄົນ, ສໍາລັບແຕ່ລະຖານທີ່ 4 nucleotide. ພື້ນຖານ fluorescent-labeled ຖືກເພີ່ມ, ແລະ laser ໃນເຄື່ອງມື illuminates ປ້າຍ, ການອ່ານຂອງ strands ໄດ້ປະຕິບັດວ່າຖານ labeled ໂດຍສະເພາະ. ປ້າຍດັ່ງກ່າວແມ່ນຖືກລຶບແລ້ວ, ແລະຮອບຕໍ່ໄປເລີ່ມຕົ້ນດ້ວຍຖານໃຫມ່. ຫຼັງຈາກຫ້ອງການໄຫຼໄດ້ຮັບການປິ່ນປົວດ້ວຍຖານແຕ່ລະຄົນ (4 ຮອບ), quad ແມ່ນສໍາເລັດແລ້ວ, ແລະໃຫມ່ກໍ່ເລີ່ມຕົ້ນອີກເທື່ອຫນຶ່ງດ້ວຍຖານນິວເຄຼັກ.
ໃນປະຈຸບັນ, HeliScope TM ສາມາດອ່ານເອກະສານ DNA ຂອງປະມານ 55 ຄູ່ຖານທີ່ມີຄວາມຍາວ. ຖານທີ່ຫຼາຍໃນລໍາດັບ, ການຫຼຸດລົງອັດຕາສ່ວນຂອງ strands ທີ່ສາມາດຖືກນໍາໃຊ້ໃນຕົວຢ່າງ, ເນື່ອງຈາກວ່າບາງ strands ຢຸດເຊົາຂະຫຍາຍເວລາໃນຂະບວນການ.
ສໍາລັບການອ່ານຂອງຖານ 20 ຫຼືດັ່ງນັ້ນ, ກ່ຽວກັບ 86% ຂອງ strands ສາມາດຖືກນໍາໃຊ້. ສໍາລັບການອ່ານຍາວ (55 + ຖານຄູ່) ອັດຕາສ່ວນນີ້ຫຼຸດລົງປະມານ 50%.
Advantage Single-Molecule
ໃນຂະນະທີ່ບໍລິສັດອື່ນໆຈໍານວນຫນຶ່ງໄດ້ສະເຫນີເຕັກໂນໂລຢີແບບເລັ່ງປະຕິບັດໂດຍຜ່ານການສັງລວມທີ່ມີເວທີທີ່ມີຄວາມລະອຽດສູງ, ການທົດລອງຕ່າງໆທີ່ແຕກຕ່າງກັນ, ໃນຄ່າໃຊ້ຈ່າຍທີ່ທຽບເທົ່າແລະສໍາລັບການອ່ານສັ້ນຂອງ 25-40 ຄູ່ຖານເທົ່ານັ້ນ, Helicos ພຽງແຕ່ອ່ານລໍາດັບ DNA ເປັນຫນຶ່ງ nucleotide ໃນເວລາດຽວກັນ ເຕັກນິກການຕິດສະຫຼາກທີ່ມີຄວາມລະອຽດພຽງພໍເພື່ອອະນຸຍາດໃຫ້ອ່ານໃນໂມເລກຸນດຽວ. ວິທີການອື່ນໆຕ້ອງການ DNA ທີ່ຈະຂະຫຍາຍຕົວ (ການນໍາໃຊ້ PCR ) ເພື່ອເຮັດໃຫ້ຫຼາຍ (ລ້ານ) ສໍາເນົາກ່ອນທີ່ຈະ sequencing. ມັນແນະນໍາໃຫ້ມີທ່າແຮງສໍາລັບລະດັບຄວາມບໍ່ຖືກຕ້ອງທີ່ສໍາຄັນເນື່ອງຈາກຄວາມຜິດພາດໃນການປຸງແຕ່ງໂດຍ enzyme polymerase ໃນໄລຍະຂະຫຍາຍ.
ໃນເດືອນເມສາປີ 2008, HeliScopeTM ໄດ້ຖືກລາຍງານວ່າສາມາດບັນລຸເກືອບສາມພັນຖານຖານນິວເຄຼັກໆຕໍ່ມື້.
Helicos ແມ່ນສະມາຊິກຂອງອົງການຮັກສາສຸຂະພາບສ່ວນບຸກຄົນແລະໄດ້ຮັບທຶນຊ່ວຍເຫຼືອ "$ 1000 genome" . ລະບົບນິເວດ $ 1000 ໃນຫນຶ່ງມື້ແມ່ນເປົ້າຫມາຍທີ່ຄາດວ່າຈະຕ້ອງໃຊ້ sequencer ເພື່ອປະຕິບັດຫລາຍພັນຕື້ໂດລາຕໍ່ຊົ່ວໂມງ. ໃນປະຈຸບັນ, ລໍາດັບ prototype ຈະໃຊ້ເວລາຫຼາຍປີເພື່ອກໍານົດລະບົບຮີໂລ່ທັງຫມົດ, ຊຶ່ງຈະມີຄ່າໃຊ້ຈ່າຍຫຼາຍກ່ວາ $ 1000.
ຄໍາຮ້ອງສະຫມັກສໍາລັບເຕັກໂນໂລຢີ tSMSTM ແມ່ນມີຈໍານວນຫຼາຍ, ລວມທັງການກວດພົບການປ່ຽນແປງທາງພັນທຸກໍາໃນມະນຸດແລະຊະນິດອື່ນເພື່ອກໍານົດສາເຫດຂອງພະຍາດ, ການຕໍ່ຕ້ານເຊື້ອຈຸລິນຊີໃນເຊື້ອແບັກທີເຣັຍ, virility ໃນໄວຣັສແລະອື່ນໆ. ຄວາມສາມາດໃນການກວດພົບເຊື້ອໂຣກດຽວທີ່ບໍ່ມີການຂະຫຍາຍຕົວມີການນໍາໃຊ້ເຕັກໂນໂລຢີດ້ານສິ່ງແວດລ້ອມຫຼາຍຢ່າງເຊັ່ນເຕັກນິກພັນທຸກໍາຖືກນໍາໃຊ້ເພື່ອກວດພົບເຊື້ອຈຸລິນຊີທີ່ບໍ່ສາມາດປູກໄດ້ຫຼືສິ່ງທີ່ພົບໃນດິນແລະເມັດອື່ນໆທີ່ຫ້າມແຍກກັນໂດຍວິທີການປະຈຸບັນ. ນອກຈາກນັ້ນ, ລັກສະນະຂອງຕົວຢ່າງສິ່ງແວດລ້ອມມັກຈະສະແດງຄວາມຫຍຸ້ງຍາກໃນການນໍາໃຊ້ໂປຼແກຼມທີ່ໃຊ້ໂປຼແກຼມ PCR, ເນື່ອງຈາກບັນຫາການປົນເປື້ອນ. ຢ່າງໃດກໍ່ຕາມ, ຄວາມຫຍຸ້ງຍາກເຫຼົ່ານີ້ຍັງຈະຕ້ອງໄດ້ຮັບການແກ້ໄຂເພື່ອໃຫ້ທາດໂປຼເມີຣ໌ເຣັດທີ່ໃຊ້ໃນ tSMSTM ເຮັດວຽກໂດຍບໍ່ມີການແຊກແຊງ.
ທິດສະດີດ້ານ sequencing single-molecule ແມ່ນພື້ນຖານພື້ນຖານ, ແລະທ່ານອາດຈະຖາມວ່າເປັນຫຍັງບໍ່ມີໃຜຄິດເຖິງມັນກ່ອນ. ເຖິງແມ່ນວ່າມັນມີຄວາມງ່າຍດາຍພຽງພໍ, ມີອົງປະກອບດ້ານວິຊາການຈໍານວນຫນຶ່ງທີ່ມີສ່ວນຮ່ວມໃນການພັດທະນາເວທີດັ່ງກ່າວແລະມີຄວາມທ້າທາຍຫລາຍຢ່າງທີ່ເຮັດໃຫ້ Helicos ມີຄວາມຫຍຸ້ງຍາກ, ລວມທັງການພັດທະນາປະຕິກິລິຢາເຄມີໃຫມ່ແລະ reagents, ແຜ່ນແລະອ່ານສູງ. ຄວາມສາມາດໃນການຊອກຫາ fluorescence ຂອງປ້າຍດຽວຢູ່ໃນຖານດຽວຕ້ອງ ໃຊ້ເຄື່ອງມືທີ່ມີຄວາມໄວສູງ ແລະເຄມີສໍາລັບການຕິດສະຫຼາກແລະການກວດສອບສັນຍານຕ້ອງມີສິດທິທີ່ຈະ ຫຼຸດຜ່ອນການແຊກແຊງແລະປັບປຸງຄວາມຊື່ສັດ ຂອງ DNA polymerase ຍ້ອນວ່າມັນຖືກນໍາໃຊ້ກັບແມ່ແບບທີ່ບໍ່ມີ immobilized ແລະຕິດສະຫຼາກ nucleotides ເຫຼົ່ານີ້ແມ່ນບາງສິ່ງທ້າທາຍທີ່ປະເຊີນກັບໂດຍ Helicos ຍ້ອນວ່າມັນຍັງສືບຕໍ່ພັດທະນາເຕັກໂນໂລຢີນີ້ໃນຄວາມຫວັງໃນການສະເຫນີວັນລະ 1000 ໂດລາຕໍ່ມື້ຂອງມະນຸດ.